Desde octubre de 2021 las autoridades capitalinas clausuraron la construcción de la academia de futbol del club Atlante en suelo de conservación de Santo Tomas Ajusco, en Tlalpan, por no contar con autorización de impacto ambiental, y al año siguiente se le sancionó con 391 mil 191 pesos y la restauración de 2.8 hectáreas del terreno.

Información de la Comisión de Recursos Naturales y Desarrollo Rural, así como de la Secretaría del Medio Ambiente refieren que el club ha pedido en reiteradas ocasiones el levantamiento de la clausura sin presentar dicho documento ni cumplir con las sanciones.

Nuevamente en abril pasado se ordenó una nueva inspección en la que se registró que el club quebrantó la clausura al construir en el predio.

El 14 de octubre de 2021 se realizó la primera visita de inspección para determinar si contaba con la autorización de impacto ambiental por las obras de desmonte y terraceo que se realizaron en el predio de 37 mil metros cuadrados del paraje El Llano, delimitado en ese momento por una malla ciclónica, pero al no exhibir dicha licencia se estableció una clausura temporal.

El 18 de noviembre de ese año el club solicitó el retiro de la medida a partir de una opinión de uso de suelo para actividades de campos deportivos que si bien el Programa General de Ordenamiento Ecológico permite, se insistió en que debía tramitar el estudio de daño ambiental y se concedieron prórrogas para realizar el trámite que hasta mayo de 2022 no había efectuado.

El 25 de octubre de 2022 la Dirección General de Evaluación de Impacto y Regulación Ambiental emitió la resolución por daño ambiental con la clausura y las sanciones. El club solicitó información del procedimiento para cumplir, pero tampoco lo hizo.

El 15 de agosto otra verificación dejó en claro que se quebrantó la clausura al hallar 28 personas que realizaban trabajos de construcción, y el viernes personal de las dependencias intentó recuperar el predio e inició la demolición, pero comuneros lo impidieron.